Normalerweise legt man individuelle Scripte im Homeverzeichnis in Unterordners sortiert ab. Will man diese aber für Systemweite Aufgaben einsetzen und diese gar in Cron-Jobs nutzen, wird es schnell unübersichtlich.
Typischerweise speichere ich meine Cron Skripte in:
/usr/local/bin/
für Skripte die für mehr als einen User laufen sollen/usr/local/sbin/
für Skripte die als Root laufen sollen